为进一步健全机构编制监督检查工作机制，严肃机构编制纪律，增强机构编制管理的权威性，山东省烟台市委编办以“三台账”“一清单”“一指南”逐步完善机构编制监管服务体系，不断提升机构编制管理的科学化、规范化和制度化水平。
一、抓好“三个台账”，严格规范机构编制日常监管程序。一是建立《机构编制问题整改台账》。本着应纳尽纳、应改尽改的原则，建立了市县两级机构编制问题整改台账，分为“违规问题”“政策性超编问题”两个子台账。对纳入台账管理的机构编制问题实行动态管理，对于己整改完毕的问题，及时销号；对于新增加的问题，及时列入，确保一事一账、全程留痕。二是建立《领导职数管理台账》。为全面掌握全市领导职数核定情况，实现对全市机关事业单位领导职数的精准监管、动态监测和统计分析，根据省统一部署，在市县两级均建立了《机关事业单位领导职数管理台账》。通过集中统一管理，进一步提高了机构编制违规违纪情况的预警监测能力，确保对全市领导职数核定情况做到“心中有数”。三是建立《市级机构编制运行监管台账》。依托《领导职数管理台账》，全面梳理市级机关事业单位机构编制基础信息及数据，建立起《市级机构编制运行监管台账》，详细收录机构名称、机构规格、机构类别、编制数、编制结构、部门（及内设科室）领导职数以及机构历史沿革（含设立、调整、合并分设、隶属变化、加挂牌子等情况）等各类机构编制基础信息，对相应信息发生变动的适时调整、及时更新，为领导全面了解市级机关事业单位机构编制概况提供了详实数据。
二、建立“问题清单”，系统排查机构编制管理问题。为进一步加强机构编制日常管理，履行监督职责，在机构编制问题台账的基础上，结合党政群机构改革和事业单位改革，充分利用实名制数据库和事业单位监督管理信息系统，全面查找梳理在机构编制日常管理工作中存在的不规范问题，将事业单位未分类、单位类型与经费来源不一致、机构规格不低于主管部门、机关事业单位法人登记（注销）不及时、超编、超职数（规格）配备领导干部等问题，分类纳入清单管理，注明文件管理依据，与《市级机构编制运行监管台账》一并按期汇总成册，印发相关业务科室，并跟踪督导整改落实情况，为进一步加强机构编制管理和服务领导决策提供依据。
三、编制“工作指南”，汇总完善机构编制监管制度。为进一步加强和规范机构编制管理，确保监督检查工作有据可依，有法可循，系统编制了《机构编制运行监管政策规定汇编》（以下简称《汇编》），作为机构编制管理规定的“工作指南”，它既是领导科学决策的“参考书”，也是机构编制干部学习和掌握有关政策规定、更好开展工作的“工具书”。《汇编》共分“监督检查政策规定”“监督检查工作制度”“机构编制综合管理规定”三个板块共计115个文件，其中，监督检查政策规定文件12个、监督检查工作制度文件24个、机构编制综合管理类文件及有关规定79个。