按照党中央对地方机构改革的总体部署要求，新疆昌吉州编办坚持政治引领、突出对表对标、强化问题导向、搞好统筹融合，主动下好“先手棋”，打出深化党政机构改革“组合拳”。
坚持政治引领。牢牢把握正确的政治方向，切实把思想和行动统一到中央关于全面深化党和国家机构改革的决策部署上来，不打折扣、不搞变通，为党政机构改革“保驾护航”。严肃严明机构改革“六项”纪律，在全面冻结机构编制、暂停人事调整、强化执纪监督的基础上，开展涉改部门经费、资产、债权债务清理登记及办公用房、土地清理核查，停止办理涉改部门资产处置、更换、核销相关业务，坚决防止国有资产流失，为下一步及时高效完成涉改部门资产划转、接收做好准备。加强保密宣传，对改革内容知悉范围、涉密文件管理等作出明确规定，对可能出现的热点问题、突发事件等，及时做好阐释引导、积极回应社会关切。凡对外发布的改革信息，均需层层审核把关签字后方可发布，做到守土有责、守土尽责、守土负责。
突出对表对标。以思想解放推动观念转变，立足于学改革精神、理改革思路、教改革方法、作改革动员，召开深化党政机构改革领导小组办公室第一次主任会议，先后举办两期深化党政机构改革专题培训班，组织机改办工作人员开展9次集中轮训，深入学习党和国家机构改革方案和新组建国家部委的职能配置、内设机构和人员编制规定。将学习成效作为检验推进改革的重要载体，在把握中央改革精髓的基础上，逐条逐个梳理出涉及部门的机构编制调整情况，按照自治区明确规定的地县两级机构限额，回顾和总结近年来全州机构改革的实际成效，提出此次机构改革的总体设想，对“自选动作”可能涉及的方方面面，条分缕析，做到胸有成竹。
强化问题导向。坚持问题和目标导向，紧紧围绕精简机构设置、减少管理层级、理顺职责职能等重点，对州本级各部门职能配置、机构设置和人员编制配备情况进行梳理，先后到农业、国土、卫生计生等40个涉改部门开展实地调研，找准理清改革推进过程中的短板弱项，预估分析此次机构改革过程中面临的主要问题和困难。通过座谈交流、实地查勘等形式，充分听取意见建议，特别是对职能划转中存在的职能交叉、职责不清问题，认真与部门负责人交流探讨，带着问题讨论，迎着问题求解，做到有的放矢。通过全面细致的摸底调研，为下一步拟定自治州党政机构改革方案奠定基础，也为后期各部门科学拟定“三定”规定草案做好业务指导和服务。
搞好统筹融合。坚持互融互促、统筹推进。把承担行政职能事业单位改革、权责清单动态调整和此次深化党政机构改革结合起来，明确各县市结合本轮党政机构改革职能调整和机构整合情况，在拟定《县市深化党政机构改革方案》的同时，同时拟定《县市承担行政职能事业单位改革方案》和《权责清单调整方案》。要求县市在全面清理职能的基础上，按照能转职能的不转机构，确需转机构的实行综合设置，区分情况推进改革；确需单设为行政机构的，纳入机构限额管理。同时在拟定方案时，同步考虑所属事业单位整合设置和布局结构调整等问题，借力改革，统筹做好相关配套工作，将改革效益最大化。